Historia Kanji'ego Sasahary, świeżo upieczonego studenta Uniwersytetu Shiiou, i jego przyjaciół z klubu Genshiken (Stowarzyszenia na Rzecz Studiowania Nowoczesnej Kultury Wizualnej - Gendai Shikaku Bunka Kenkyuukai). Pod szumną nazwą klubu kryje się grupa otaku spędzająca czas na konwentach i w sklepach z fanowskimi mangami. Czy żyjący w swoim świecie bohaterowie poradzą sobie z prozą życia prezentowaną przez bardzo zasadniczą przewodniczącą samorządu studenckiego?